בעת ניקוי הדופן הפנימית של אמבט ג'קוזי, שימו לב לדברים הבאים: • השתמשו בכלי ניקוי העשויים מחומרים מתאימים • הימנעו משימוש במברשות שוחקות יתר על המידה • נגב את כל המשטחים באופן שווה הדופן הפנימית היא האזור בו המשתמש נוגע ישירות, ולכן ניקויה חשוב במיוחד.

בתנאים מסוימים, אמבטיות ג'קוזי ספא אכן עלולות לפתח עובש. במיוחד כאשר המכשיר אינו מתוחזק כראוי או מנוקה לעתים רחוקות, סביר יותר שייווצר עובש בתוך המכשיר או על פני השטח.

רוב אמבטיות הג'קוזי המודרניות מצוידות במערכות סינון ומסננים ייעודיים, אשר ממלאים תפקיד מכריע בשמירה על ניקיון המים. המסננים מסייעים בהסרת זיהומים, חלקיקים וכמה מזהמים מהמים, תוך שמירה על ניקיון המים ומפחיתים את הצטברותם של חומרים מזיקים.

רמות כלור גבוהות כשלעצמן אינן גורמות ישירות למי ג'קוזי בספא להצהיב. כלור הוא חומר חיטוי יעיל. במינונים רגילים או מוגזמים, הוא אינו מייצר ישירות פיגמנטים צהובים או משחרר תרכובות שהופכות מים לצהיבים.

לפני הכניסה לאמבטיה, מרחו קלות שכבה של שמן שיער טבעי (כגון שמן קוקוס, שמן ארגן או שמן חוחובה) על קצוות השיער. שמנים אלה יוצרים שכבה מגן על השכבה החיצונית של השיער, ומפחיתים את השחיקה של מים חמים וכימיקלים.

טבילת הראש באמבט ג'קוזי ספא מהווה מספר סיכונים, כולל זיהום מיקרוביאלי, גירוי כימי, פגיעה גופנית וחנק. גם אם אמבט הג'קוזי מעוקר, מגע ישיר של הראש עם מים עדיין עלול לגרום לבעיות בריאותיות.